Trung tâm Kiểm soát bệnh tật tỉnh Khánh Hòa (Trung tâm KSBT) là đơn vị sự nghiệp y tế công lập trực thuộc Sở Y tế, có tư cách pháp nhân, có trụ sở, có con dấu, có tài khoản riêng tại Kho bạc Nhà nước và Ngân hàng theo quy định của pháp luật.

Trung tâm KSBT chịu sự chỉ đạo, quản lý trực tiếp, toàn diện về chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ, tổ chức, nhân lực, hoạt động, tài chính và cơ sở vật chất của Sở Y tế; chịu sự chỉ đạo, hướng dẫn, kiểm tra, thanh tra về chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ theo phân cấp quản lý.

Trung tâm KSBT có chức năng tham mưu và tổ chức thực hiện các hoạt động chuyên môn, kỹ thuật, nghiệp vụ về phòng, chống dịch, bệnh truyền nhiễm; bệnh không lây nhiễm; phòng, chống tác động của các yếu tố nguy cơ ảnh hưởng tới sức khỏe; quản lý sức khỏe cộng đồng; khám phát hiện, điều trị dự phòng và các dịch vụ y tế khác phù hợp với lĩnh vực chuyên môn trên địa bàn tỉnh Khánh Hòa theo quy định của pháp luật.

Trung tâm KSBT có các phòng chức năng: Phòng Tổ chức – Hành chính; Phòng Kế hoạch – Nghiệp vụ; Phòng Tài chính – Kế toán và các Khoa, phòng chuyên môn: Khoa Phòng, chống bệnh truyền nhiễm; Khoa Phòng, chống HIV/AIDS; Khoa Phòng, chống bệnh không lây nhiễm; Khoa Dinh dưỡng; Khoa Sức khỏe môi trường – Y tế trường học; Khoa Bệnh nghề nghiệp; Khoa Truyền thông giáo dục sức khỏe; Khoa Ký sinh trùng – Côn trùng; Khoa Dược – Vật tư y tế; Khoa Xét nghiệm – Chẩn đoán hình ảnh – Thăm dò chức năng; Phòng Khám tư vấn và điều trị dự phòng; Phòng Khám đa khoa; Phòng Khám chuyên khoa HIV/AIDS và Điều trị nghiện chất./.