Trung tâm Y tế huyện Giao Thủy là đơn vị sự nghiệp công lập tuyến huyện với 5 phòng chức năng, 15 khoa chuyên môn, Trạm Y tế 22 xã, thị trấn. Hiện nay, tuyến huyện đơn vị có hơn 130 y bác sỹ, điều dưỡng, dược sỹ, kỹ thuật viên, hộ sinh và tuyến xã hơn 100 cán bộ, y bác sỹ.  Khuôn viên Trung tâm Y tế với diện tích gần 20 ngàn m² , khu điều trị gồm 8 dãy nhà diện tích hơn 7 ngàn m^{2 .}. Cơ sở vật chất có nhiều khu vực xuống cấp, thiết kế lạc hậu, rất khó bố trí các khoa phòng. Các phòng chức năng bố trí không hợp lý, khoa Dinh dưỡng không đảm bảo. Trung tâm được trang bị các trang thiết bị y tế hiện đại như: Máy xét nghiệm huyết học, máy xét nghiệm sinh hóa, máy xét nghiệm miễn dịch, hệ thống mổ nội soi, hệ chụp X – quang kỹ thuật số, máy siêu âm màu 4D, máy nội soi Tai – Mũi – Họng, hệ thống nội soi dạ dày, tá tràng, đại tràng, bàn mổ thủy lực…